GOSemSim

第一次写软件包,计算基因和GO的语义相似性。

实现Wang的方法,基于GO的图结构。
以及四种基于信息含量的计算方法(Resnik, Jiang, Lin, Rel)。

可以从Bioconductor下载到。
http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/GOSemSim.html
http://bioconductor.org/packages/devel/bioc/html/GOSemSim.html

支持human, rat, mouse, fly, yeast, zebrafish,worm, E coli, arabidopsis等物种。

下载量统计如下:

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